晴雪7521

圣路易斯大学生物系 生物信息学研究组（pi：dapeng zhang 副教授）拟招收博士研究生，计划于2025年秋季入学，提供全额奖学金。欢迎具有生物，计算机，数学及统计等相关专业背景、并且对科研感兴趣的学生申请。具体的研究课题包括：比较基因组; 蛋白质及基因组进化；开发新的数据分析方法; 鉴定微生物的毒素系统（比如最新的antiphage systems）及开发疾病治疗的应用；鉴定微生物抗生素的抑制机理和进化；机器学习及深度学习的基因组分析的应用。

详细信息请访问实验室主页： http://zhangbioinfo.weebly.com/ or
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phd申请要求：
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申请截至日期： 12 月 15 日

有兴趣的同学请发简历至 dapeng.zhang@slu.edu

selected recent publications from the lab:

gu y, li h, deep a, enustun e, zhang d, corbett k. bacterial shedu immune nucleases share a common enzymatic core regulated by diverse sensor domains. molecular cell 2024, in press.

tan y, aravind l, zhang d. genomic underpinnings of cytoplasmic incompatibility: cif gene neighborhood diversification through lateral transfers and recombination in wolbachia. genome biology and evolution 2024, 16(8):evae171.

tan y, scornet al, yap yf, zhang d. machine learning-based classification reveals distinct clusters of non-coding genomic allelic variations associated with erm-mediated antibiotic resistance. msystems 2024, 9(7):e0043024.

zhao q, bertolli s, park y, tan y, cutler kj, srinivas p, asfahl kl, garcia cf, gallagher l, li y, wang y, coleman-derr d, dimaio f, zhang d, peterson b, veesler d, mougous jd. streptomyces umbrella toxin particles block hyphal growth of competing specie. nature 2024, 629: 165╟17361)

shields k, ranava d, tan y, zhang d, yap mf. epitranscriptional m6a modification of rrna negatively impacts translation and host colonization in staphylococcus aureus. plos pathogens 2024, 20 (1), e1011968.202360)

li h, schneider t, tan y, zhang d. ribonuclease t2 represents a distinct circularly permutated version of the becr rnases. protein science 2023, 32(1):e4531.

关于圣路易斯大学：学校属于天主教私立大学，us news 大学排名 #105 （national universities），位于圣路易斯市，学校坏境非常漂亮，学生构成也很好。
关于圣路易斯市：这里是美国第20大城市，生活很方便，有很大的中国社区，很多中国商店，饭店。同时这里工作机会也非常多，比如著名的拜耳公司 （前孟山都（monsanto）就在这里。同时还有sigma，百威啤酒，很多药厂及生物技术公司。
至于治安，实际上这里和美国的其他城市一样，有好区和坏区：城市北面治安不好，但是学校周围，及大家居住的城市西面南面都是很安全，漂亮的区域。