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 楼主| 发表于 2022-9-19 16:22:49 | 显示全部楼层 |阅读模式
和csc的项目。感兴趣者请将英文版cv和transcript发送至 dr. marian breuer (marian.breuer@maastrichtuniversity.nl) 并向他直接咨询其他信息。

Project title: Computational systems biology versus human aging: Targeting cellular aging and senescence through metabolic modeling
Project leader: Dr. Marian Breuer
Function: Assistant Professor
Collaborators: Dr. Michiel Adriaens, Prof. Dr. Ilja Arts

proposal (250 words):
引言:人口老龄化在世界范围内造成了重大的公共卫生负担。衰老涉及细胞和组织水平上相互交织的过程。特别是,细胞衰老,一种永久性生长停滞的异质表型,是组织衰老的重要驱动因素。针对衰老的干预措施,例如针对这种衰老状态,可以延长健康寿命并促进再生医学。细胞衰老与新陈代谢有显着联系,这表明了潜在的干预策略;然而,这些关系的特征不够充分。

假设和目标:该项目将研究伴随细胞衰老,特别是衰老的代谢变化,目的是确定可能的新特征和生物标志物,以及针对衰老细胞的更具选择性和特异性的药物的可能代谢靶点。  

设置和方法:将使用转录组学和代谢组学等组学数据重建年轻、老年和衰老人体细胞的代谢网络。计算机代谢模型将用于分析和比较条件之间的代谢特征。这种比较不仅可以揭示细胞衰老和衰老的代谢特征,还可以确定可以在细胞水平上逆转衰老过程的干预目标。

影响:特定代谢干预目标的发现将有助于开发更具体的抗衰老药物。代谢特征和生物标志物的开发有助于识别和监测衰老细胞,这对于研究抗衰老药物的功效是必要的。总体而言,该项目将有助于抗衰老精准医学的发展——最终促进人口健康老龄化。

要求候选人:积极主动的学生,具有良好的英语沟通能力和积极、果断的态度。理想的候选人一方面应具有生物化学和细胞代谢方面的基础,另一方面应具有一些计算技能,最好是在 Matlab 中。如果申请人能够提出能够在其他方面赶上的情况,仍然欢迎仅具有生化或计算方面背景的申请。

关键词:人类健康与疾病的生物学基础、重大新药发现、计算生物学、系统生物学、代谢建模、衰老

前5名入选出版物:
1. M. Breuer, TM Earnest, C. Merryman, KS Wise, L. Sun, MR Lynott, CA Hutchison III, HO Smith, JD Lapek Jr., DJ Gonzalez, V. de Crécy-Lagard, D. Haas, AD Hanson, P. Labhsetwar, JI Glass, Z. Luthey-Schulten “最小细胞的基本代谢” eLife (2019), 8:e36842。引文(Web of Science):35
2. Prickaerts, P.*, Adriaens, ME*, Beucken, T.. 等。“Hypoxia 通过 H3K27me3 的特定增益增加全基因组二价表观遗传标记”,Epigenetics & Chromatin (2016), 9: 46. Citations (Web of Science): 34
3. M. Breuer, KM Rosso, J. Blumberger “电子流在多血红素细菌细胞色素中是血红素电子相互作用和氧化还原电位之间的平衡行为”,Proc。国家石油公司。学院派。科学。美国 (2014), 111: 611. 自 2016 年以来的引用次数 (Web of Science): 81
4. X. Jiang, B. Burger, F. Gajdos, C. Bortolotti, Z. Futera, M. Breuer, J. Blumberger “十血红素细菌蛋白 MtrC 和 MtrF 中三叉电子流的动力学” Proc。国家石油公司。学院派。科学。美国 (2019) 116: 3425. Citations (Web of Science): 24
5. M. Breuer, KM Rosso, J. Blumberger, JN Butt “Shewanella oneidensis MR-1 中的多血红素细胞色素:结构、功能和机会”, JR SOC。Interface (2015) 12: 20141117. 自 2016 年以来的引文(Web of Science):102

其他详细信息:
- 持续时间:四年
- 无强制性课程
- 英语:在托福、雅思或其他考试中取得良好成绩,但英语语言技能将主要在个人面试中进行评估
- 合作项目——马斯特里赫特大学的预留名额有限;除此之外,还可以通过普通项目申请
- 更多信息:
  - www.maastrichtuniversity.nl/um-china-team#um-csc
  - www.maastrichtuniversity.nl/phd-project-outlines
- 联系方式:
  - Marian Breuer 博士:marian.breuer@maastrichtuniversity.nl
  - Renaud Jolivet 博士教授:r.jolivet@maastrichtuniversity.nl

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